自从好莱坞影星安吉丽娜·朱莉,通过基因检测发现携带基因突变,为避免日后乳腺癌的发生,进行了乳腺全切除后,大家猜渐渐熟知,原来肿瘤基因的检测可以提早预防肿瘤的发生,甚至对肿瘤的治疗也能起到“精准医疗”的作用,其实,近年来,早有大量科学研究已经证实,绝大多数肿瘤是由遗传、环境及感染等因素引起,而且均从导致基因损伤开始。
在第十届“csco-南方”肿瘤生物治疗与分子靶向治疗论坛上,中国科学院院士、南方医科大学肿瘤研究所名誉所长姚开泰教授介绍,目前,正在进行的癌瘤基因组的分析极有可能为癌症的检测和诊断开辟新的道路。
二代测序仪推动癌瘤基因组研究
近年来,基因测序行业发展迅速,二代测序为主流技术。现下,一代基因测序技术由于通量较低、测序时间较长,已经不能满足研究应用的需要,以高通量低成本为特征的二代测序技术为目前应用最广泛的测序技术,测序时间相较于一代技术大大降低。
姚开泰介绍,二代测序技术的优势主要表现在,测序费用减少,时间缩短;灵敏度提高,及时一小部分肿瘤细胞中的突变也能检出;可以定量,能同时检出核苷酸序列和拷贝数的变异;可和其他检测手段(如检测一些结构变化)结合一起。
基因分析:抓住癌瘤中的突变
为何基因测序能预测肿瘤的发生以及治疗?姚开泰表示,首先要了解癌瘤中的突变,(1)体细胞突变:突变攻击生殖细胞系以外的一个细胞的基因组:根据定义,这样一种突变不能传递给下一代有机体。(2)驱动(突变):突变造成一个等位基因,这有利于支持该基因的细胞,导致带有这种特殊突变的细胞子孙后代克隆性扩增。(3)过客(突变):突变并不授与发生突变的细胞以选择有事,但在一细胞群体中选择优势增强是存在的,因为同其他突变等位基因都在同一基因组内,而它们确实授了优势:有时被称为旁观者突变。(4)错义突变:突变引起一个氨基酸的取代。
体细胞突变是癌瘤细胞基因组中最关键的改变:即使在一种特殊的癌瘤类型中,各个肿瘤在常见的碱基取代中显示了广泛的变异:
1、最常见的成人癌瘤,例如乳腺癌、乱草、结直肠、胰腺、胶质瘤等,癌瘤基因组内常有1000-10000取代突变;
2、突变教授的癌瘤:髓母细胞瘤、睾丸生殖细胞瘤、急性白血病、类癌;
体细胞突变的一个子集转变成驱动突变,已经碰巧列入一组关键基因,被称为“癌瘤基因”,从而赋予赘生物克隆以生长优势,允许其比正常细胞在相同组织中扩增快,侵入周围组织,经常转移。在一癌瘤细胞中驱动突变数反映了癌瘤基因数,从而使抑制正常细胞转变为有症状的癌瘤克隆所需的细胞生物学过程失效。
癌瘤基因组检测的临床意义
癌症基因组学技术正逐渐走向临床应用,为癌症能在基因层面实现更早期检测、分型、用药指导、预后监测提供科学依据。姚开泰表示说,从基因层面防癌治癌,确实可以预测癌症高危人群,提高癌症预防工作的目标性和有效性,同时可以提高癌症诊疗技术的有效性和针对性,改善患者的生存和预后状况。(通讯员:朱钦文、吴佳仪)
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